If you replace the following code in kendo.dialog.js, it will behave as expected; modified code is in bold. It should start around line 706 depending on your version.

var Alert = PopupBox.extend({
            _init: function (element, options) {
                var that = this;
                PopupBox.fn._init.call(that, element, options);
                that.wrapper.addClass(KALERT);
                that.result = $.Deferred();
            },
            options: {
                name: 'Alert',
                modal: true,
                actions: [
                    {
                        text: '#: messages.okText #',
                        primary: true,
                        action: function (e) {
                            e.sender.result.resolve();
                        }
                    }]
            }
        });
        kendo.ui.plugin(Alert);
        var kendoAlert = function (text) {
            var alertDialog = $(templates.alert).kendoAlert({ content: text }).data('kendoAlert').open();
            return alertDialog.result;
        };