For the time being the CommonTooltipsAppearance.Shared property must be set to false. For example:
<telerik:RadHtmlChart ID="RadHtmlChart2" runat="server" Layout="Sparkline" Width="100" Height="150">
<PlotArea>
<CommonTooltipsAppearance Shared="false"></CommonTooltipsAppearance>
<Series>
<telerik:LineSeries>
<TooltipsAppearance>
<ClientTemplate>
Value: #=value# <br />
Category #=category#
</ClientTemplate>
</TooltipsAppearance>
<SeriesItems>
<telerik:CategorySeriesItem Y="30" />
<telerik:CategorySeriesItem Y="10" />
<telerik:CategorySeriesItem Y="20" />
</SeriesItems>
</telerik:LineSeries>
</Series>
<XAxis>
<Items>
<telerik:AxisItem LabelText="item 1" />
<telerik:AxisItem LabelText="item 2" />
<telerik:AxisItem LabelText="item 3" />
</Items>
</XAxis>
</PlotArea>
</telerik:RadHtmlChart>